Bodø bystyre bruker formannskapsmodellen hvor ¼ av bystyret sitter i et formannskap hvor partiene er representert forholdsmessig med flere underkomiteer hvor bystyrerepresentatene er medlemmer. De senere år har det også kommet enkelte som ønsker å innføre parlamentarisme med byråd i Bodø kommune. I mars 2006 ble det nedsatt et demokratiutvalg som innstilte på at «Bystyret er positiv til at parlamentarisme kan innføres som styringsform i Bodø
kommune.» og at de ønsket å utrede dette,[1] men det fikk ikke flertall da det kom opp til behandling.
Kommunen er inndelt i totalt ti valgkretser, etter at Helligvær og Landegode valgkretser ble innlemmet i sentrum valgkrets fra og med kommunestyre- og fylkestingsvalget 2015.
Bodø Ungdomsråd (BUR) består av representanter fra alle ungdomsskoler og videregående skoler i hele Bodø kommune. Rådet har 20 medlemmer, og vervet innenfor rådet varer i et kalenderår, med valg om høsten. Hver skole har sitt interne valg, som foregår som et direkte demokrati. Hvordan skolene velger å organisere valget er opp til hver enkel skole. Ungdomsskolene har én representant, mens de videregående skolene har fire representanter. Skolene skal ha vararepresentanter, og alle skolene er pliktig til å stille opp med sine representanter, uavhengig av hvem som egentlig kommer.